行政院國家永續發展委員會「生物多樣性組」在其行動計畫中指定內政部(營建署城鄉發展分署)主辦「完成重要濕地與珊瑚礁區域分布圖」，並將中央研究院、教育部及行政院農業委員會列為該案的協辦單位。

營建署為辦理劃定「國家重要濕地」作業，落實維護本土生物多樣性工作，推動相關濕地生態旅遊及教育，並向國際社會宣示我國的保育作為，特別訂定「劃定『國家重要濕地』作業推薦須知」，並於2006年12月14日召開「國家重要濕地」推薦說明會，請相關部會、直轄市、縣(市)政府、民間團體及學術單位協助辦理。

2007年起，營建署展開一系列全國重要濕地推薦與評選；歷經一年努力，評選結果於12月10日出爐。其中台南縣市的「曾文溪口濕地」及「四草濕地」經評定為國際級濕地。

出版「2007國家重要濕地彙編」的主要目的，除介紹「國家重要濕地」評選過程及成果外，還將彙整75處「國家重要濕地」生態資源及特色，作為各界對濕地三育(保育、復育及教育)的參考依據。