本計畫分別於2007年夏、秋、冬三季進行半屏湖濕地與洲仔濕地公園環境監測調查，本調查與過去文獻整合累計結果：洲仔濕地有240科747種生物，含第一級保育類 1 種、第二級保育類 13 種、第三級保育類 2 種、特有種 27 種、特有亞種 22 種、外來種 37 種；半屏湖濕地有124科330種生物，含第二級保育類 6 種、第三級保育類 3 種、特有種 5 種、特有亞種 8 種、外來種 11 種，調查報告已全部上網 (http://www.wetland.org.tw/project/chibpl/)，可供民眾隨時調閱。半屏湖濕地不僅提供過境鳥類中途休息點，更有來自洲仔濕地的鴛鴦出現，顯示鳥類生態廊道正在形成。

　　就大型水生動物群聚而言，半屏湖濕地是變動較大的棲息地，洲仔濕地是較穩定的棲息地。洲仔濕地的水生植物---台灣萍蓬草及大安水蓑衣為台灣特有種，宜蘭水蓑衣為新紀錄種，牠們在野外不是很稀少就是瀕臨絕種。半屏湖濕地有高位珊瑚礁特有植物，但洲仔濕地從中海拔到低海拔、乾旱到潮濕的植物皆人為栽植。半屏湖、洲仔濕地的外來魚種分別佔該地的80.0%、73.3%，嚴重威脅本土魚類。外來魚種以吳郭魚數量最多，而洲仔濕地的線鱧還會獵食水雉、鴛鴦及紅冠水雞等鳥類的幼鳥，降低洲仔濕地幼鳥存活率。

　　洲仔濕地兩棲爬蟲類優勢種皆為外來種，分別為牛蛙、多線南蜥。外來種牛蛙因有特別留意並進行移除，而得以降低其威脅，但多線南蜥可能在兩濕地已壓迫長尾南蜥的族群，另外來種亞洲錦蛙也入侵半屏湖濕地。洲仔濕地刻意栽植蝴蝶食草與蜜源植物，已成功提昇蝴蝶種類；並透過多樣水域環境營造，將蜻蜓數量提昇到23種。半屏湖有台灣近十年來數量變較稀少的碧翠晏蜓，而半屏山前山生物資源，也可成為日後經營半屏湖濕地時，生物自然拓殖的種源地。