1990年，行政院院會通過成立交通部高速鐵路工程局籌備處，高鐵預定路線中的281k到282k的橋墩，正好座落在水雉重要的棲息地∼葫蘆埤。因此高鐵籌備處於環評報告書中承諾「將在德元埤、葫蘆埤附近生態較敏感的地區進行深入調查，務必施工之前，蒐集完整的動物生態資料，以提出具體確實的減輕對策，並將之納入工程設計與施工方法當中，以確實做好野生動物衝擊減輕對策」。

葫蘆埤原有景觀(攝影：鄧伯齡)	高鐵的開發影響水雉生態(攝影：許勝發)

1994年，高鐵環評有條件通過，環評結論「在生態部份，高速鐵路經過水雉、彩鷸等野生動物繁殖區之部份，請另提保育計畫送審，未獲審查同意，該路段不得動工。」

1997年，行政院農委會野生動物諮詢委員會第八次會議決議「高鐵路線經過水雉、彩鷸等野生動物繁殖區之部份，尚未有具體保護措施，請另提保育計畫送審，未獲審查同意，該路段不得動工。」

1998年，環保署經過四次的審查，同意通過「高速鐵路水雉等保育計畫草案」其結論的第二條「應完成15公頃棲地租用事宜後，該路段始得動工。」保育團體在此次的審查過程中提出了下列看法：

水雉復育區應接近葫蘆埤，水源供應方便且以公有土地為佳。